โครงสร้าง
สนามบินนานาชาติอู่ตะเภา ดำเนินการบริหารโดยคณะกรรมการบริหารสนามบินอู่ตะเภา ซึ่งแต่งตั้งจากกองทัพเรือโดยอาศัยอำนาจจากมติคณะรัฐมนตรี เมื่อ 21 ก.พ. 32 โดยอนุมัติให้กองทัพเรือเป็น ผู้บริหารสนามบินอู่ตะเภาร่วมกับกรมการบินพาณิชย์ และต่อมาเมื่อ พ.ศ.2539 ทร.ได้อนุมัติจัดตั้งอัตรากองการท่าอากาศยานอู่ตะเภา เพื่อพลางขึ้นโดยมีโครงสร้างการจัดตามที่แสดงในแผนภาพ
โดยมีหน้าที่ต่างๆ พอสังเขป ดังนี้
กองบริหาร กำกับดูแลและรับผิดชอบงานให้เป็นไปตามนโยบายของผู้บังคับบัญชาในงานด้านต่างๆ ดังนี้
1. งานด้านกำลังพล
2. งานด้านธุรการ
3. ด้านกฏหมาย
4. งานด้านสุขาภิบาลและสิ่งแวดล้อม
5. งานด้านการเงินและการบัญชี
6. งานพัสดุ
7. งานวิชาการและแผนงาน